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生本教育就各学科的慧根及课程路线、课堂金标准做了具体的阐释。（慧根是知识之根和人性之根的结合，即知识的生成和人的生命结合。课程路线即该学科教什么、怎么教，或者说学什么、怎么学。）

语文的慧根就是字和篇。语文的课程路线是从语文分析转为语文实践。语文课堂的金标准：是否推进了阅读。

数学的慧根就是思想和知识起点。数学的课程路线是从数学知识讲授转向数学思维。数学课堂的金标准：是否抓住了根本（思想发生处、知识形成处、结论推导出、新旧结合处）。

英语的慧根是单词及句法。英语的课程路线是从英语传输转向英语活动。英语课堂的金标准：（自己的、整体的、有生命意义的、强烈的）活动形成没有。

物理的慧根是大量的以体验为基础的、贴近学生的物理现象。物理的课程路线是从物理知识的传授到物理概念和法则、方法的主动形成。物理课堂的金标准：物理材料与物理思维的互动是否形成。

化学的慧根是物质结构决定化学性质的基本现象，化学的体验。化学的课程路线是从化学知识的传授，到化学概念、法则和方法的主动形成。化学课堂的金标准：化学存在与化学思维的互动形成了没有。

生物的慧根是贴近学生的生物现象,或基本问题。生物的课程路线是从生物知识的传授到生物概念和法则的形成。生物课堂的金标准：生物存在与生物思维的互动形成没有。

历史的慧根基本的历史事实。历史的课程路线可以归纳为变历史知识传输为用历史事实论证历史思维。历史课堂金标准：由历史事实到思维的论证发生没有。

地理的慧根是地理原理的基本例证。地理的课程路线是从地理材料和观点的灌输转向地理存在和原理的互动。地理课堂的金标准：基本例证找到没有。

政治的慧根是承载政治思想观点的实例。政治课程路线是从政治观点的灌输转向正确的思思想观念的形成和发展。政治课堂的金标准：政治思考发生了没有。